01 февраля 2018 года был подписан договор о сотрудничестве между школой № 2099 и Российским национальным исследовательским медицинским университетам имени Н.И. Пирогова, договор о сотрудничестве в сфере образования двух образовательных организаций станет основой для решения задач по развитию образования (медико-биологического и естественнонаучного направлений), подписанный договор предусматривает установление долгосрочных партнерских отношений.
РНИМУ им. Н.И. Пирогова и ГБОУ Школа 2099 договорились об объединении содержательных, организационных, технологических, методических и экспертных ресурсов в реализации создаваемых совместных программ, проектов и инициатив в интересах устойчивого развития и повышения качества образовательных возможностей школы, учащихся и педагогов.
Ключевыми направлениями сотрудничества станут:
В 2010 году Университет, единственный среди медицинских вузов России, получил статус "Национальный исследовательский университет" на 2010-2019 годы.
В 2011 году приказом Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации Российский государственный медицинский университет переименован в Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова.
Рейтинги РНИМУ им. Н.И. Пирогова в рейтингах вузов
Школа 2099 официальный партнер РНИМУ имени Н.И. Пирогова, информация на официальном сайте университета http://www.rsmu.ru/1583.html